将残基链弯曲穿过网格，使疏水单元挤进埋藏的核心中，并将能量压缩到已证明的最低水平。
蛋白质被建模为二维晶格上的疏水 (H) 和极性 (P) 残基链。相邻但未结合的疏水邻居会降低能量。您的目标是折叠链条，使 H 残基形成紧凑的核心，从而达到最佳能量。
Helixfold 建立在蛋白质折叠的经典疏水极性晶格模型之上，将寻找折叠变成了一个谜题。
由疏水残基和极性残基组成的链排布在格点上，非键合的H-H接触会降低能量，这就是蛋白质折叠的HP模型。
直接为能量评分，而不是为与某个已知形状的相似度评分，是本作原创的方法。
能量是正确的目标，因为它正是大自然所要最小化的东西。疏水效应驱使非极性残基向内聚集，而一个几乎只包含这一点的模型，仍然能再现真实蛋白质所具有的紧凑内核——这就是为什么HP模型至今仍是一种教学和研究工具。
Helixfold 基于蛋白质折叠的经典疏水极性晶格模型而构建，将对最小能量构象的搜索变成了触觉难题。这是一款原创、免费的网页游戏，具有三种链长和每日加练习模式。