Helixfold
将残基链弯曲穿过网格,使疏水单元挤进埋藏的核心中,并将能量压缩到已证明的最低水平。
怎么玩
蛋白质被建模为二维晶格上的疏水 (H) 和极性 (P) 残基链。相邻但未结合的疏水邻居会降低能量。您的目标是折叠链条,使 H 残基形成紧凑的核心,从而达到最佳能量。
- 单击残基可将链尾部围绕其旋转。
- 交替单击相同的残基以沿相反方向旋转。
- 使用“旋转”按钮翻转默认枢轴方向(顺时针/逆时针)。
- 达到可证明的最小链能量以赢得难题。
控制
- 桌面:单击残基进行旋转,再次单击进行反转,切换“旋转”,然后使用“重置”进行拉直。
- 手机和平板电脑:轻按残留物即可旋转 - 完全触摸友好。
提示与策略
- 计算 H-H 接触,而不是形状——每个最终相邻的非键合疏水对都会降低能量。
- 目标是紧凑的斑点而不是长臂; H残留物暴露的表面积是浪费的能量。
- 当折叠停止时,重置并尝试首先从最密集的 H 残基簇中播种核心。
你将学到什么
Helixfold 建立在蛋白质折叠的经典疏水极性晶格模型之上,将寻找折叠变成了一个谜题。
- 技能:生物化学、蛋白质折叠、HP模型、优化
- 最适合:高级高中/大学
- 致家长和老师:HP 蛋白质折叠模型。
关于螺旋折叠
Helixfold 基于蛋白质折叠的经典疏水极性晶格模型而构建,将对最小能量构象的搜索变成了触觉难题。这是一款原创、免费的网页游戏,具有三种链长和每日加练习模式。
免费的原创浏览器游戏 — 无需下载。查看全部游戏 →